- Trong phạm vi thẩm quyền quy định tại khoản 1 Điều 16 của Pháp lệnh, Trưởng Đoàn kiểm toán ra quyết định xử phạt đối với hành vi vi phạm hành chính thuộc phạm vi, nội dung cuộc kiểm toán trong thời hạn kiểm toán theo quy định của Luật Kiểm toán nhà nước.
- Trường hợp hết thời hạn kiểm toán theo quy định của Luật Kiểm toán nhà nước mà chưa thể ra quyết định xử phạt vì lý do khách quan, thì phải chuyển vụ vi phạm đến Kiểm toán trưởng đơn vị chủ trì cuộc kiểm toán để ra quyết định xử phạt.