Tại cuộc họp, Phó Tổng KTNN Lê Minh Khái đã chỉ đạo các thành viên của Tổ rà soát khẩn trương soạn thảo công văn gửi các đơn vị, đề nghị các đơn vị đánh giá thực tiễn áp dụng Quy chế làm việc của KTNN kể từ năm 2006 đến nay, nêu rõ thuận lợi, khó khăn, tồn tại và những đề xuất sửa đổi bổ sung cần thiết đối với Quy chế làm việc. Song song với quá trình này, Phó Tổng KTNN cũng yêu cầu 7 thành viên của Tổ rà soát tiến hành tự nghiên cứu, rà soát. Cụ thể, Vụ TCCB được giao nghiên cứu Chương 1, 2, 3; Văn phòng KTNN nghiên cứu Chương 4, 5, 9, 10; Vụ Pháp chế nghiên cứu chương 6, 7, 8. Trong quá trình nghiên cứu, Tổ rà soát cần tham khảo kỹ Quy chế mẫu của Chính phủ. Theo đó về mặt thời gian, từ nay đến 31/12/2011 các đơn vị trong toàn ngành và Tổ rà soát phải hoàn thành xong việc rà soát, cho ý kiến sửa đổi, bổ sung về Quy chế làm việc của KTNN. Từ 1/1/2012 đến 23/1/2012, Tổ rà soát tổng hợp các ý kiến và hoàn thiện Dự thảo Quy chế sửa đổi bổ sung lần 1. Đầu tháng 2/2011 gửi Dự thảo Quy chế sửa đổi bổ sung lần 1 cho các đơn vị để xin ý kiến lần cuối trước khi hoàn chỉnh trình Tổng KTNN ban hành. Thời điểm trình Tổng KTNN theo dự kiến là vào cuối tháng 2/2012./.
Quy chế làm việc của KTNN ban hành năm 2006 gồm 10 chương, với 45 điều quy định về nguyên tắc, chế độ trách nhiệm, lề lối làm việc, quan hệ công tác và trình tự giải quyết công việc của KTNN. Cán bộ công chức, viên chức và người lao động trực thuộc KTNN; các tổ chức cá nhân có quan hệ làm việc với KTNN chịu sự điều chỉnh của Quy chế này.