Tổng KTNN Vương Ðình Huệ cho biết, trước yêu cầu của công cuộc đổi mới đất nước, xây dựng Nhà nước pháp quyền và xu thế hội nhập, phát triển kinh tế quốc tế, năng lực, hiệu lực và hiệu quả tổ chức, hoạt động của KTNN đã bộc lộ nhiều hạn chế như: Quy mô và chất lượng chưa ngang tầm với chức năng nhiệm vụ được giao; chưa có sự thống nhất, đồng bộ giữa các quy định của Luật KTNN và các luật liên quan như Luật Tổ chức Quốc hội, Luật Tổ chức Chính phủ, Luật NSNN... Ðiều đó, làm giảm hiệu lực, hiệu quả trong tổ chức, hoạt động của KTNN. Theo Tổng KTNN, những hạn chế nêu trên có nguyên nhân chủ yếu là do địa vị pháp lý của KTNN chưa được quy định trong Hiến pháp theo khuyến cáo của Tổ chức các cơ quan Kiểm toán tối cao quốc tế (INTOSAI) và thông lệ nhiều nước trên thế giới.