Năm 2006 là năm đầu tiên Đoàn thanh niên KTNN thực hiện Nghị quyết số 03 NQ/ĐU ngày 17/02/2006 về lãnh đạo công tác thanh niên trong KTNN. Bởi vậy, Đoàn thanh niên KTNN đã không ngừng nâng cao vai trò của mình trong các hoạt động, góp phần tích cực vào sự nghiệp phát triển chung của ngành: công tác giáo dục chính trị tư tưởng và công tác chuyên môn nghiệp vụ được xác định là những nhiệm vụ trọng tâm. Điểm nổi bật trong năm qua là Đoàn thanh niên đã xây dựng chương trình giới thiệu KTNN trên phần mềm Powerpoint, giúp cho các đơn vị hoặc kiểm toán viên dùng để giới thiệu về hình ảnh KTNN khi giao lưu trong nước cũng như học tập, hội thảo ở nước ngoài. Một số Chi đoàn đã ứng dụng công nghệ thông tin hỗ trợ lập biên bản kiểm toán, có Chi đoàn mạnh dạn tổ chức Tổ kiểm toán thanh niên, đây thực sự là một tổ chức mang tính sáng tạo, năng động cần được phát huy nhân rộng thành phong trào trên toàn ngành.
Cũng tại Hội nghị, các chi đoàn bộ phận trực thuộc Đoàn thanh niên đã đóng góp xây dựng nhiều nội dung rất thiết thực như cải tiến hình thức sinh hoạt Đoàn để phù hợp đặc thù công tác của KTNN là đi xa, phân tán; tổ chức lao động gây quỹ Đoàn; thành lập Tổ kiểm toán kiểu mẫu và một vấn đề đặc biệt được nhấn mạnh là văn hoá nghề nghiệp. Đây là vấn đề sẽ được Đoàn thanh niên KTNN chú trọng nhất trong năm tới và triển khai cụ thể dưới hình thức các buổi toạ đàm.
Hội nghị lần này được tổ chức trong bối cảnh Đoàn thanh niên KTNN chuẩn bị làm thủ tục chuyển sinh hoạt Đoàn từ Quận đoàn Ba Đình về Đoàn khối I cơ quan Trung ương, bắt đầu với một cơ cấu sinh hoạt phù hợp hơn với đặc điểm của Đoàn thanh niên KTNN.