Tháng 10/2006 đã hoàn thành 69 cuộc kiểm toán. Tổng KTNN đã xét duyệt 55 dự thảo Báo cáo kiểm toán và đã phát hành 23 báo cáo kiểm toán, trong đó đã kiến nghị xử lý tài chính 1921 tỉ đồng. Các đơn vị trong toàn ngành đã hoàn thành cơ bản các nhiệm vụ được giao. Tuy nhiên, tiến độ báo cáo kiểm toán vẫn chậm vì các đơn vị chưa thực sự chủ động trong việc hoàn thiện báo cáo kiểm toán sau khi thông qua đơn vị được kiểm toán; nhiều báo cáo chưa được kiểm tra, rà soát kỹ trước khi trình Tổng KTNN, do đó còn mất thời gian rà soát, chỉnh sửa lại.
Về nhiệm vụ trọng tâm công tác tháng 11, Tổng KTNN giao nhiệm vụ cụ thể cho từng đơn vị: Vụ Tổ chức cán bộ triển khai thực hiện Đề án tuyển dụng, thi tuyển cán bộ, công chức theo chỉ tiêu đã được duyệt và phân bổ cho các đơn vị; Vụ Quan hệ quốc tế chuẩn bị các điều kiện cần thiết để tổ chức Hội thảo về kiểm toán hoạt động, mở 2 lớp tập huấn về kiểm toán chuyên đề do chuyên gia KTNN Cộng hoà Liên bang Đức giảng dạy; Vụ chế độ và Kiểm soát chất lượng kiểm toán tiếp tục tập trung thực hiện việc kiểm tra hồ sơ kiểm toán của các đoàn kiểm toán theo kế hoạch, tổng hợp kết quả kiểm tra, lập báo cáo kiểm tra theo chỉ đạo của Tổng KTNN… Ngoài ra. Tổng KTNN chỉ đạo các đơn vị sớm xây dựng lịch công tác tháng 12/2006 và quý 1/2007.