Đề tài “Hướng dẫn kiểm toán đối với các đơn vị sự nghiệp y tế công lập” được kết cấu thành 2 chương: Cơ sở lý luận về kiểm toán các đơn vị sự nghiệp y tế công lập và thực trạng kiểm toán các đơn vị sự nghiệp y tế công lập của KTNN trong giai đoạn 2014-2016; Hướng dẫn kiểm toán đối với đơn vị sự nghiệp y tế công lập
Đơn vị sự nghiệp công lập nói chung và đơn vị sự nghiệp y tế công lập nói riêng là các đơn vị thường xuyên được lựa chọn kiểm toán khi KTNN tổ chức kiểm toán việc quản lý, sử dụng tài chính công, tài sản công của các bộ, ngành hay kiểm toán ngân sách địa phương. Qua quá trình kiểm toán các đơn vị sự nghiệp y tế công lập trong những năm qua, các Đoàn kiểm toán của KTNN cũng đã phát hiện nhiều sai sót trong thực hiện cơ chế tự chủ tài chính của các đơn vị này và bên cạnh đó là những bất cập của cơ chế, chính sách cần phải sửa đổi, bổ sung. Tuy nhiên, với loại hình hoạt động có nhiều đặc thù như các bệnh viện, cơ sở y tế, kết quả kiểm toán cũng còn những hạn chế khi có những hoạt động chưa được kiểm toán một cách đầy đủ, chưa đưa ra được những nhận định, đánh giá một cách rõ ràng, xác đáng như định mức tiêu hao vật tư hóa chất trong các phác đồ điều trị, chi phí tiêu hao trong hoạt động khám chữa bệnh...
Đề tài sau khi được hoàn thành sẽ có tác dụng như một cẩm nang định hướng dành cho các kiểm toán viên được phân công kiểm toán các bệnh viện, cơ sở y tế ứng dụng khi thực hiện nhiệm vụ, góp phần đảm bảo cho hoạt động kiểm toán có thể nhận xét, đánh giá, kết luận một cách đầy đủ toàn diện hoạt động của các đơn vị này.