Để bảo đảm thực hiện đầy đủ chức năng, nhiệm vụ của Kiểm toán Nhà nước (KTNN) theo quy định của Luật Kiểm toán nhà nước; bảo đảm thực hiện trách nhiệm, quyền hạn của Tổng KTNN, Phó Tổng KTNN theo đúng quy định của Luật Kiểm toán nhà nước, Quy chế làm việc và Quy định phân cấp quản lý cán bộ của KTNN; bảo đảm chuyên môn hoá theo từng lĩnh vực công tác, vừa bảo đảm tạo điều kiện cho Lãnh đạo KTNN hiểu rõ các mặt công tác khác của ngành; đồng thời bảo đảm tính ổn định, kế thừa, có sự điều chỉnh từng bước cho phù hợp và bảo đảm tính hợp lý, hiệu lực, hiệu quả và thuận lợi trong giải quyết công việc; ngày 08/4/2011, Tổng KTNN ký ban hành Quyết định số 499/QĐ-KTNN về việc phân công nhiệm vụ lãnh đạo KTNN. Theo đó, các đồng chí Lãnh đạo KTNN được phân công phụ trách các lĩnh vực như sau:
