Ngày 13/2/2006 Đảng ủy cơ quan KTNN đã ra Nghị quyết số 02-NQ/ĐU về việc lãnh đạo triển khai thi hành Luật KTNN
Luật KTNN đã được Quốc hội thông qua và có hiệu lực thi hành từ 01/01/2006. Để chuẩn bị triển khai thi hành Luật KTNN, ngay sau khi Luật được thông qua, Tổng KTNN đã ban hành Quyết định thành lập Ban chỉ đạo triển khai thi hành Luật KTNN. Ban chỉ đạo đã xây dựng kế hoạch, phân công nhiệm vụ cụ thể cho các thành viên. Đảng ủy cơ quan KTNN đã chỉ đạo cấp ủy các Đảng bộ, chi bộ trực thuộc tập trung lãnh đạo các đơn vị triển khai thi hành Luật KTNN theo kế hoạch của Ban chỉ đạo. Trong quá trình triển khai, cấp ủy các cấp, Ban chỉ đạo và thủ trưởng các đơn vị đã có sự phối kết hợp chặt chẽ trong lãnh đạo, chỉ đạo các bộ phận tham gia thực hiện, các nội dung công việc đề ra trong kế hoạch đã được triển khai thực hiện một cách đồng bộ. Đến tháng 9/2005 UBTVQH đã ban hành 02 Nghị quyết về cơ cấu tổ chức của KTNN và quy trình xây dựng và ban hành hệ thống chuẩn mực KTNN. Các dự thảo Nghị quyết, Quyết định trình UBTVQH, Thủ tướng Chính phủ, Bộ Công an đã được hoàn thành về cơ bản.
Nhận thức được nhiệm vụ lãnh đạo, chỉ đạo triển khai thi hành Luật KTNN có ý nghĩa hết sức quan trọng đối với cấp ủy và lãnh đạo các cấp của KTNN trong giai đoạn hiện nay, Đảng ủy cơ quan KTNN đã đề ra một số nhiệm vụ cần chú trọng là: Các Đảng bộ, chi bộ trực thuộc lãnh đạo các cấp chính quyền lựa chọn cán bộ có năng lực, tạo điều kiện thuận lợi để cán bộ, đảng viên tham gia các bộ phận triển khai thi hành Luật KTNN khẩn trương hoàn thành trong quý I/2006 các dự thảo Nghị quyết, Quyết định và các văn bản có liên quan; cấp ủy các Đảng bộ, chi bộ lãnh đạo việc học tập, nghiên cứu, tập huấn về Luật KTNN và các văn bản hướng dẫn thi hành Luật; Ban Tuyên giáo Đảng ủy phối hợp với Tạp chí Kiểm toán tổ chức tuyên truyền, phổ biến Luật KTNN một cách rộng rãi đến các cơ quan, đơn vị, tổ chức thuộc đối tượng kiểm toán và mọi tầng lớp nhân dân; lãnh đạo hoàn thiện tổ chức bộ máy của KTNN theo quy định của Luật KTNN.../.